Eva Mosner studierte von 1998 bis 2004 Diplom-Biologie mit dem Schwerpunkt Pflanzenökologie und Naturschutz an den Universitäten Marburg und Potsdam. 2005 war sie angestellt als wissenschaftliche Mitarbeiterin am Helmholtz-Zentrum für Umweltforschung, Department Landschaftsökologie. Von 2006 bis 2009 war sie wissenschaftliche Mitarbeiterin an der Universität Marburg im Fachgebiet Naturschutzbiologie und promovierte dort im Jahr 2012. Parallel arbeitete sie von 2009 bis 2014 an der Bundesanstalt für Gewässerkunde im Referat für ökologische Wirkungszusammenhänge. Seit Juni 2014 ist sie wissenschaftliche Mitarbeiterin am Institut für angewandte Ökologie, Professur für Biodiversität und Ökosystemfunktionen.